אללה ישתבח שמו ויתעלה אומר בספרו הנשגב: " ישתבח שמו של המסיע את עבדו בלילה מן אל-מסג'יד אל-חראם אל מסגד אל-אקצה אשר נתנו ברכתנו על סביבותיו, למען נראה לו את אותותינו. הוא שומע ומבחין." (סורת המסע הלילי:1).

מסגד אלאקצה הוא ראשון משני כיווני התפילה באיסלאם ומקום המסע הלילי של הנביא מוחמד ומשם הוא עלה לשמים.

 יתר על כן, הוא אחד המסגדים שהמוסלמים מבקרים בו. אבו הוריירה ירצהו אללה סיפר כי הנביא מוחמד עליו ברכה ושלום אמר: "אל תצאו למסע חוץ משלושת המסגדים, המסג'יד אל-חראם במכה, המסג'יד של שליח אללה (מסג'יד הנביא מוחמד עליו ברכה ושלום באל-מדינה) ומסג'יד אלאקצה.

(מסופר על ידי אל-בוח'ארי ומוסלם)

התפילה במסגד אל-אקצה היא שווה ערך לחמש מאה תפילות במסגדים אחרים, פרט ;למסגד הקדוש במכה  ומסגד הנביא באל-מדינה.